Η καρπουζιά μπορεί να απειληθεί σοβαρά από μία εδαφογενή και δύσκολα αντιμετωπίσιμη ασθένεια: την Αδροφουζαρίωση. Πρόκειται για μία ασθένεια που προκαλείται από το παθογόνο Fusarium oxysporum  και προσβάλλει αποκλειστικά την καρπουζιά προκαλώντας μαρασμό και ξήρανση των φυτών.