Η χρήση καλλιεργειών κάλυψης έχει τη δυνατότητα ελέγχου ασθενειών εδάφους. Αλλά καθώς η άμεση αποτελεσματικότητα τους είναι πιο μικρή σε σχέση με πιο δραστικές μεθόδους, όπως χημική απολύμανση ή εφαρμογές με υψηλή θερμοκρασία, πρέπει να χρησιμοποιούνται με αποτρεπτικό και στρατηγικό τρόπο.