Ο περιορισμός των προσβολών από τα κοκκοειδή, πρέπει να βασίζεται περισσότερο σε καλλιεργητικά μέτρα και λιγότερο σε εφαρμογές φυτοπροστατευτικών. 

Σημειώνεται αύξηση των προσβολών από σημαντικούς εντομολογικούς εχθρούς όπως είναι η Μύγα της Μεσογείου, ο Φυλλοκνίστης και οι Αλευρώδεις.

Η κλιματική αλλαγή απειλεί πολλές από καλλιέργειες στην περιοχή της Μεσογείου. Η καλλιέργεια του αβοκάντο γίνεται μια ρεαλιστική και κυρίως ενδιαφέρουσα οικονομικά εναλλακτική στην καλλιέργεια εσπεριδοειδών.

Ο έλεγχος της αφίδας Aphis gossypii είναι απαραίτητος διότι είναι φορέας του ιού της τριστέζας των εσπεριδοειδών (Citrus tristeza).

Στα εσπεριδοειδή υπάρχουν πολλοί φυσικοί εχθροί οι οποίοι ρυθμίζουν ικανοποιητικά τους πληθυσμούς των βλαβερών εντόμων.

Σε μεγάλο πρόβλημα εξελίσσεται η ασθένεια του μαύρου αλευρώδους που πλήττει τα εσπεριδοειδή στην Ήπειρο και τα Ιόνια Νησιά.

Από τον τακτικό έλεγχο εγκατεστημένων από την ΔΑΟΚ Θεσπρωτίας κίτρινων κολλητικών παγίδων σε προσβεβλημένα δέντρα, διαπιστώθηκε η έναρξη πτήσεων ενηλίκων του εντόμου Αleurocanthus spiniferus στην παραλιακή ζώνη της Π.Ε. Θεσπρωτίας, γεγονός που σηματοδοτεί την εμφάνιση της πρώτης γενεάς του έτους και την έναρξη διασποράς του εντόμου.

Η φυτόφθορα προσβάλλει τον κορμό των δένδρων καθώς και τα φρούτα και καταστρέφει πολλά από αυτά μετά τη συγκομιδή.

Το φθινόπωρο ορισμένες ποικιλίες πορτοκαλιών και μανταρινιών εμφανίζουν σκισίματα στο φλοιό και σκασίματα στη σάρκα.

Στους οπωρώνες που υπάρχουν προσβολές να γίνει καταπολέμηση. Ο ψεκασμός πρέπει να είναι επιμελημένος, με έμφαση στο εσωτερικό της κόμης των δένδρων.